利用条件

当データベース(以下、データベース)は、Open Database License(ODbL)の下で利用可能です。

あなたは自由に

あなたの従うべき条件は以下の通りです。

データベースに取り込まれた各データ(コンテンツ)の利用にあたっては、下記のデータの輩出元のライセンスに従ってください。

上記は一般の人に読みやすいようにした要約です。日本語訳はOpenStreetMap Japan(OSMJ)による日本語試訳を参考にしました。

適用される実際のライセンス条件については、ODbL 1.0ライセンス契約の全文(OSMJによる日本語試訳はこちら)を参照してください。

また、帰属表示は帰属(クレジット)表示例を参考にしてください。

ライセンス表示は、ODbLライセンスの採用例の表記を参考にしてください。

帰属(クレジット)の表示例

1. TogoVarデータベースの利用に対する引用方法

TogoVarデータベース全体を引用する場合

TogoVar [Internet]. Tokyo: Japan Science and Technology Agency (Japan), National Bioscience Database Center; 2018 - [cited YYYY Mmm DD]. Available from: https://togovar.biosciencedbc.jp

TogoVarの特定の変異(tgv47264307)を引用する場合の例

Variant [Internet]. Tokyo: Japan Science and Technology Agency (Japan), National Bioscience Database Center; [2018] - . TogoVarID tgv47264307; [cited YYYY Mmm DD]. Available from: https://togovar.biosciencedbc.jp/variant/tgv47264307

2. TogoVarデータベースに取り込まれた各データ(コンテンツ)の引用方法

利用するコンテンツに応じて以下の引用をしてください。正式には各コンテンツの利用条件を参照ください。

Colil [利用条件:http://colil.dbcls.jp/portal/]

T. Fujiwara and Y. Yamamoto, "Colil: a database and search service for citation contexts in the life sciences domain.", Journal of Biomedical Semantics, 6:38 (19 October 2015). doi:10.1186/s13326-015-0037-x

ExAC [利用条件:http://exac.broadinstitute.org/about]

Lek, M., Karczewski, K. J., Minikel, E. V., Samocha, K. E., Banks, E., Fennell, T., … Consortium, E. A. (2016). Analysis of protein-coding genetic variation in 60,706 humans. Nature, 536(7616), 285-291. http://doi.org/10.1038/nature19057

HGVD Release Version 2.30 (08/02/2017) [利用条件:http://www.hgvd.genome.med.kyoto-u.ac.jp/about.html]

K. Higasa et al. "Human genetic variation database, a reference database of genetic variations in the Japanese population" J Hum Genet 61:547-553, 2016, doi: 10.1038/jhg.2016.12

Integrative Japanese Genome Variation Database 3.5KJPN [利用条件:https://ijgvd.megabank.tohoku.ac.jp/download_3.5kjpn/]

(Long version)

Rare variant discovery by deep whole-genome sequencing of 1,070 Japanese individuals, Nagasaki M, Yasuda J, Katsuoka F, Nariai N, Kojima K, Kawai Y, Yamaguchi-Kabata Y, Yokozawa J, Danjoh I, Saito S, Sato Y, Mimori T, Tsuda K, Saito R, Pan X, Nishikawa S, Ito S, Kuroki Y, Tanabe O, Fuse N, Kuriyama S, Kiyomoto H, Hozawa A, Minegishi N, Douglas Engel J, Kinoshita K, Kure S, Yaegashi N, ToMMo Japanese Reference Panel Project and Yamamoto M, Nat Commun, 21; 6:8018 (2015)

(Short version)

Rare variant discovery by deep whole-genome sequencing of 1,070 Japanese individuals, Nagasaki M, Yasuda J, Katsuoka F, ToMMo Japanese Reference Panel Project and Yamamoto M, Nat Commun, 21; 6:8018 (2015)

PubTator [利用条件:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/lu/PubTator/README.txt]

Wei CH et. al., PubTator: a Web-based text mining tool for assisting Biocuration, Nucleic acids research, 2013, 41 (W1): W518-W522. doi: 10.1093/nar/gkt44

JGA-NGS dataset [利用条件:https://togovar.biosciencedbc.jp/datasets/jga_ngs]

Variant set aggregated from NGS data in NBDC Human Database/JGA [Internet]. Tokyo: Japan Science and Technology Agency (Japan), National Bioscience Database Center; [2018] - . JGA-NGS dataset; [cited YYYY Mmm DD]. Available from: https://togovar.biosciencedbc.jp/datasets/jga_ngs

JGA-SNP dataset [labeled_link_to:https://togovar.biosciencedbc.jp/datasets/jga_snp]

Variant set aggregated from SNP-chip data in NBDC Human Database/JGA [Internet]. Tokyo: Japan Science and Technology Agency (Japan), National Bioscience Database Center; [2018] - . JGA-SNP dataset; [cited YYYY Mmm DD]. Available from: https://togovar.biosciencedbc.jp/datasets/jga_ngs

ODbLライセンスの採用例